Прохождение консульской проверки в Израиле как-то отличается, если уже получено предварительное подтверждение по go no go? Или это одобрение только для бесплатных билетов?

Насколько я понимаю - не отличается. Консул может посмотреть на одобрение, но оно не является определяющим для его решения. Gonogo позволит Вам сократить количество вопросов в аэропорту.