Подскажите, кто в курсе Из Сербии в Германию на машине попасть вариант? Есть виза Эстонии.

Сербия и Германия не имеют общей границы;)) Внутри Шенгена у вас есть возможность проехать в Германию без проверок. А как и где вы из Сербии попадете в Шенген, надо узнавать соответственно в правилах той страны.