Может, кто в курсе, есть ли такое гласное/ негласное правило, что в Нидерланды нежелательно въезжать (по действующей визе типа c) в процессе оформления MVV в IND?

Строго не рекомендовано, но не запрещено я и несколько знакомых девушек находились в Нидерландах в процессе ожидания я ответ получила, находясь там.

Официально не рекомендовано, да. И даже в принципе вообще в шенген. Причина - что они проверяют ваши правонарушения на территории шенгена, когда принимают решение. Если вы там находитесь, то типа можете совершить еще неучтенные правонарушения.