Подскажите пожалуйста гражданка Киргизии сможет прилететь из РФ в Узбекистан?

Да.

Авиаперелет из городов РФ в Узбекистан разрешён с обязательным предоставлением справки о прохождении проверки ПЦР (действительна не более чем за 72 часа до вылета рейса) гражданам Республики Узбекистан, Российской Федерации, Республики Казахстан и Киргизской Республики. Пассажиры без справки ПЦР на рейсы авиакомпании допущены не будут.