Кто-нибудь знает, могу ли я въехать в беларусь по израильскому паспорту, а не по российскому?

Можешь.

А тогда обратно тем же путём: из России по российскому внутреннему паспорту в Беларусь, а из Беларуси по даркону?

А вы уверены, что вас пустят в Белоруссию обратно по русскому паспорту?.... не факт.