Добрый день. Собираюсь долететь до Карлсруэ, повести день в Баден Бадене, и 3-4 дня в Страсбурге, обратно в Москву. Будут ли проблемы, если получу Шенген во Францию?

Проблем быть не должно, так как основная ваша цель в данном случае - Страсбург. Но советую заранее купить билеты Карлсруэ-Страсбург и обратно, чтобы у немецких таможенников (или пограничников?) не возникло вопросов.

Иными словами вам нужно доказать (при необходимости) что основная цель вашего пребывания не Германия, а Франция.