Санитарно-гигиенические условия в стране хорошие. В Полинезии высокая продолжительность жизни и низкий уровень младенческой смертности. В 1998 году основными причинами смерти были сердечно-сосудистые заболевания, рак и различные травмы.
Медицинское обслуживание находится в ведении правительства. Во Французской Полинезии открыты 34 больницы, в которых работает 369 врачей. На некоторых островах не хватает медперсонала.
Несмотря на широкое распространение современных методов лечения, в селах и деревнях до сих пор принято обращаться к лекарям и целителям. К народным средствам относятся лекарственные препараты, травяные ванны, массажи и кровопускание.