Подскажите пожалуйста едем на поезде из самарканда в Бухару. Написано регистрация за пол часа до отправления. Это как? На жд такие правила?

Да есть

Никакой регистрации , просто садитесь в свой вагон и место и всё в нужное время , могут при посадке сверить данные паспорта и билета , а могут и нет

У вас же если брали онлайн билет то регистрация уже пройдена

Все также как и в России ,никаких отличий