Я могу за друга подать документы с доверенностью и полным пакетом документов на визу в Японию?

да, об этом в доверенности нужно расписать "кем являетесь вы и причина подачи за человека" т.к вы подаете за друга, от его имени доверенность Я ФИО (паспорт такой то, проживающий там то) настоящей доверенностью уполномочиваю ФИО (ваш)(паспорт, проживающая там то), который является другом и тд. Ниже Идет ФИО (ваш), номер телефона, подпись, расшифровка. Еще ниже дата заполнения (заполняет друг), подпись расшифровка.