Подскажите пожалуйста, мы выезжаем из Кении на 2 недели в Танзанию, затем возвращаемся в Кению на 1 ночь и вылетаем в Россию.

Пропустят

Если старая еТа ещё не просрочена и вы не покидали страны восточной Африки, то новую делать не нужно.

Да. Но не забудьте прививку сделать от жёлтой лихорадки, в вашем маршруте она нужна и в Танзании, и в Кении