Подскажите, пожалуйста,можно ли пробыть в Турции без ВНЖ 40 дней и выехать, а потом через две недели заехать вновь и прожить ещё 50 дней? Или надо строго 60+30?

Так можно. Можно 45+45 (главное, не более 60 безвыездно)

Можно хоть 10+10+10+10+10+10+10+10+10, главное чтобы подряд не больше 60 и в сумме не больше 90.

На самом деле рекомендую 89 дней, потому что мало ли потом придётся лететь через Стамбул со сменой аэропорта ))