Подскажите, такая ситуация. Еду в Германию по рабочей визе. Квартиру покрывает джоб. Но агентство предложило 1 контракт для Джоба с лимитом, а второй для меня, чтоб я платил сам и не показывать джобу. Это не очень легально?

Если в Германии вам кажется, что вы делаете что то нелегально - в большинстве случаев так и есть. Тем более с жопцентром. Его задача помогать бедным, а не работающим. Ну либо тем, кто на минималке (Ацуби, к примеру)

А насколько большая разница в цене между контрактами?

Чего вы опасаетесь? Вам идут навстречу.

Ту цену которую хотят за квартиру джобцентр не будет платить и вам откажет.

Поэтому вам предлагают 1 договор с ценой которую одобрит и будет платить джобцентр а второй на оставшуюся сумму которую вы будете платить сами. Всё легально со стороны арендадателя.