Подскажите, с паспортом РФ можно в Молдову через Турцию?

С внутренним нет, с заграном да. Ну и, смотря, какие основания для въезда в Молдову.

Можно, но будьте готовы к беседе с безопасниками. Как минимум имейте при себе подтверждающую информацию о том что официально работаете в РФ, об адресе где остановитесь в Молдове, и обратный билет.

С заграном РФ конечно можно, некоторые чартеры без молдавских документов могут не посадить на рейс, заранее узнайте у АК.