Кто знает, в чем разница , если рейс один? Есть смысл брать emirates или будет то же самое, что за 60 тыс флай дубай?

Два раз летали флай Дубай , рейс у нас был компанией, но на стойке регистрации был рейс емирейтс/флай Дубай.

просто будет чуть разный сервис и какие-то нюансы, ничего более

как сравнивать Ладу и например Тойоту

Совместный рейс FlyDubai и Emirates, продают обе а/к. Фактический перевозчик, который будет выполнять рейс FlyDubai

судя по всему второй рейс (где написано эмирейтс) выполняется а/к флайдубай.

лучше уточнить, чтобы не переплатить за одно