Мы с женой хотим квартиру в Сербии купить 50/50. Можно так? 50% стоимости со своего счета перевожу и 50% стоимости со своего счета переводит жена?

Скорее всего. было наоборот - два продавца, переводил в зависимости от доли. Но и комиссию взяли двойную...

Можно с одного счета, в договоре указывается, что плательщик такой-то