Подскажите, перед тем как отправить документы для эвалюации в WES, нужно сначала оплатить (после этого WES отправить запрос в ВУЗ)?

Лучше, конечно, сначала договориться с вузом, что они точно отправят. А так после оплаты, wes вам присваивает референс номер, который должен быть указан при отправке документов. И в вашем личном кабинете можно будет скачать форму запроса для вуза, в котором уже будет штрихкод с этим номером.