Кто сталкивался с такой ситуацией . Виза заканчивается 29 числа , а вылет в ночь с 29 на 1 . Просрочка в 4 часа . Помимо штрафа есть негативные последствия ?

Штраф и нужно будет продлять. И есть шанс не вылета. Других последствий нет.

С некоторой вероятностью могут не принять ночью оплату штрафа и визы на месте, в офисе в аэропорту. и отправить в главный офис в Интрамуросе. но если вы паспортный контроль до полуночи пройдете и будете ждать в международной зоне, то все нормально будет.

Если удастся пересечь в аэропорту границу до полуночи, то обойдётся без штрафа и продления.

Можно просто попробовать пройти пограничный контроль до истечения визы.