С гражданством РФ виза до 45 дней не нужна, а если за это время выехать на пару дней в Камбоджу, то обратно уже без визы не пустят или как?

При выезде из страны ваша виза аннулируется, если это не мультивиза. При одноразовый визе, не важно, электронной на три или штамп на 45, при выезде из страны вам придется оформлять новую визу.