Подскажите, пожалуйста, в маршрутном листе при подаче на визу во Францию можно указать выезд из РФ из Сочи, а потом вовзращение в СПб?

Это ваш маршрутный лист; вам решать, как вы поедете, какой у вас план передвижений. Вас не могут обязать вернуться в Сочи, только потому что вы оттуда выехали. Но в общем и целом логика поездки должна прослеживаться.