Подскажите пожалуйста такой момент: если мы подаемся в Латвии ( мы имеем право находиться в ЕС 3 месяца)

В pmlp говорят что сейчас не дают таких документов. лучше выехать в безвиз и вернуться уже когда будет положительное решение.

Вы должны одновременно с документами выслать подтверждение пребывания в Латвии в момент отсылки документов почтой. А въехать Вы должны были, полагаю, до даты, начиная с которой въезд туристам из РФ на территорию Латвии запрещен.