Подскажите, пожалуйста, можно ли выставлять АВР/ЭСФ , если у меня окэд торговля, но нужно по другой работе выставить ЭСФ по услуге сервис обслуживания?

Через свое ИП (торговля)

Создайте ещё вторичный окэд (дополнительный) на услуги, если конечно будете не один раз делать ЭСФ/АВР. Просто потом при налоговой проверке могут признать сделку не действительной.