Если я возьму визу в июне (через день срок на 180 дней заканчивается), то смогу ли я поехать туда не сразу, а в сентябре и до января там пробыть?

Я бы посоветовал по раньше вам этим заняться т. к. в последние дни не факт, что получится успеть или ещё какие накладки. После вылета из страны можете сделать визу на 180 дней.