Какая схема полета с двумя паспортами-РФ и Израиль? На выезде из Москвы я подаю русский загран, при прилете в Израиль -израильский? И так же обратно?

Российскому пограничнику российский, израильскому - израильский (там автоматическая штука), на регистрации на рейс сотруднику авиакомпании, а также на посадке если спросят - тот паспорт, на который оформлены билеты. На контроле безопасности в РФ, который после регистрации при входе в зону предполетного досмотра -тот паспорт, на который оформлен билет. На контроле безопасности в Израиле (который до регистрации, где "с кем вы паковали свой чемодан и не везете ли вы с собой оружие") - израильский.