Подскажите, если я полгода нахожусь в республике Казахстан, встал вопрос оформления налогового резидентства Казахстана, какие последствия будут, если его не оформлять?

Как таковое резидентство не оформляется никак.

Последствий много, если вы хотите быть идеально чистым, например для того, чтобы англичане не отобрали Ваш лондонский особняк. если Вам на особняк все равно, то последствий никаких пока нет. видимо базы доходов не синхронизированы, хотя они уже много лет это обещают.

Ну вы не обязаны сертификат получать. Просто разные ставки налогов для резидентов и нерезидентов, в банках условия и др. А без сертификата вам не смогут применить условия для резидентов.