Можно ли Заехать в кыргызстан по паспорту РФ, а выехать уже по кыргызскому паспорту?

В аэропорту при мне было, показал РФ паспорт, а ему говорят у вас Кыргызский паспорт ещё есть, вот не помню только при вылете было или при прилетет.

Можно. Покупаете билет на паспорт гражданина КР и вылетаете.