Подскажите, пожалуйста, можно ли, находясь в России, через адвоката подать электронно документы на продление ВНЖ Греции?

В доверенности будет проблема. Не факт, что примут доверенность от российского нотариуса.

Надо находиться на территории Греции, находясь в РФ, то не получится. Вы должны же въезд показать.