Подскажите, пожалуйста, если прилететь в Улан-Батор и транзитом улететь в Токио, будет ли действовать пцр тест? Есть ли какие-то требования на этот счет, в частности при вылете из Монголии?

Новый пцр не нужен будет, если между пцр тестом и прилетом в Японию не пройдёт больше 72 часов. Также нельзя покидать транзитную зону. Если правила нарушены нужен новый пцр. От страны это не зависит.