Подскажите пожалуйста кто-нибудь имел опыт подачи документов на Шенген (в Испанию) с ВНЖ Сербии... Как это можно сделать? Есть специальные визовые центры или лучше самим на прямую через посольство Испании подавать?

А что мешает подать в сербии? Общее правило - без ооочень уважительной принины у Вас просто не примут документы в посольстве страны - где у Вас нет прав на долговременное пребывание. Есть исключения - но их не много и их надо указывать письменно при подаче документов.