Подскажите подача на внж останавливает (холдит) срок нахождения в стране? То есть если я подам документы например 59 день на внж, смогу ли я задержаться до решения.

Да, когда ваши документы примут, вам нужно\желательно находится в стране. для выезда вроде нужна какая-то бумажка. но если у вас закончилась виза, то вы без проблем находитесь в стране до получения внж.