Кто долго живет на Кипре по yellow slip как гражданин страны Ес, есть ли какие-то минусы или юридические проблемы?

Никакой разницы, через три года у вас есть возможность подать заявление на гражданство, а получить вы его можете и через 12 лет. С другой стороны, вам никто не мешает вступить в оба гражданства, если это не запрещено страной вашего нынешнего резиденством.