Подскажите пожалуйста правильно ли я поняла что если мы в июне были в Турции 21 день, то если в октябре мы приезжаем, то у нас осталось 39 дней безвиза?

60 дней у вас есть. Потом можете выехать и въехать и еще 9 дней будет.

Нет, 60 дней можно непрерывно, а если с перерывами то не больше 90 дней суммарно за полгода.