Подскажите, пожалуйста, возможно ли подаваться на стартап визу уже находясь в Португалии?

На визу невозможно податься изнутри страны. Может быть, как-то по доверенности можно в Мск это сделать (если вы из рф), но с “обычными” д7 такое точно не работает.