Законно ли иметь постоянную регистрацию и в РФ, и в Казахстане одновременно.

Зависит от Вашей миграционки. Если они не просят внутренний паспорт, то можно не сниматься. Для РФ это законно, в КЗ сейчас не везде строго проверяют.