Мы уехали в Таиланд из России в конце февраля, в РФ не возвращались.

На мой взгляд, вы слегка путаете понятия "выезд из Казахстана" и "въезд в Россию". Вы въедете в Казахстан из Таиланда по загранпаспорту. Через несколько дней вы выедете из Казахстана по нему же (т. е. предъявите загран на казахстанском КПП на границе). По-другому нельзя. У Казахстана к вам вопросов не будет - вы въехали и выехали через короткой промежуток времени. А вот когда вы будете проходить российскую границу, то тут уже предъявляйте внутренний паспорт РФ. Будут ли у российских пограничников к вам вопросы, сказать трудно. Но длительность и легальность пребывания в Казахстане вам точно не придется доказывать, это не компетенция российской погранслужбы. Но спросить, в каких странах вы были и что там делали, они, конечно, могут.