Подскажите пожалуйста, как можно добраться из Маргариты в Каракас самостоятельно? И насколько это безопасно?

Никак.

Ээ.. но вроде ж купить у конвиасы билеты (типа 100-140$ туда обратно?) не запрещено? ну и добраться то, думаю, вполне безопасно. (вот гулять по Каракасу самостоятельно я бы уже поостерёгся, это да)